Setelah lulus dari SMP, Kuroko Tetsuya dan Kagami Taiga mendaftar di SMA Seirin dan bergabung dengan klub basket. Para senior klub dikejutkan oleh bakat Kagami yang luar biasa dan Kuroko yang memiliki hawa kehadiran yang tipis. Ternyata, saat masih SMP, Kuroko adalah pemain misterius yang dijuluki sebagai “Pemain Bayangan Keenam” yang bermain bersama lima pemain jenius yang dikenal sebagai “Generasi Keajaiban” dan telah memenangkan kejuaraan tiga kali berturut-turut. Kombinasi baru “Cahaya” dan “Bayangan” yang dimainkan Kagami dan Kuroko menjadi kunci permainan mengagumkan di tim SMA Seirin dan berhasil mencapai tingkat nasional setelah menjuarai turnamen Winter Cup dengan mengalahkan “Generasi Keajaiban”.